Odporne szczepy drobnoustrojów mogą:
- Wytwarzaj enzymy modyfikujące leki (na przykład beta-laktamazy);
- Zmień strukturę, na którą działa lek;
- Użyj linii metabolicznej innej niż zahamowana;
- Zmieniają przepuszczalność komórek, zapobiegając przejściu lub adhezji cząsteczki o działaniu antybiotykowym.
GEN R, który przenosi oporność na antybiotyki, znajduje się w plazmidach, a w szczególności w TRANSPOZONACH (dlatego transpozon może być znaleziony w plazmidzie, ale także zintegrowany z chromosomem opornej bakterii).
Więcej informacji znajduje się w dedykowanym artykule: Bakterie: genetyka i mechanizmy przekazywania informacji genetycznej
organizmu, zwykle stanowiący GRAM - Należy również pamiętać, że sam antybiotyk nie tworzy oporności (która wynika z mutacji i transferu genów), ale ją selekcjonuje. Z drugiej strony oporność nie jest zjawiskiem adaptacji do antybiotyku, ale zdarzeniem – spontanicznym i zakaźnym – które wpływa na dziedzictwo genetyczne bakterii.
Aby dobrać najbardziej odpowiedni antybiotyk w każdej sytuacji, konieczne jest wyizolowanie bakterii poprzez zastosowanie odpowiednich analiz i testów (pobieranie próbek wymazami, biopsje itp.).Bakterie są następnie zmuszane do replikacji w odpowiedniej pożywce hodowlanej; następnie różne antybiotyki są testowane metodą zwaną antybiogramem.
Bakterie są następnie rozsiewane (termin techniczny wysiane lub zaszczepione) na szalce Petriego zawierającej podłoże agarowe (stałe), wewnątrz którego rozmieszczone są krążki z papieru chłonnego (tzw. bibula). Każdy z tych krążków nasączony jest określonym antybiotykiem. Po 24 godzinach oceniany jest wzrost bakterii wokół krążka: im większy promień hamowania, tym skuteczniejszy będzie antybiotyk.
Istnieją dwa rodzaje antybiogramów, jeden bezpośredni i jeden pośredni. Pierwszy jest wykonywany bezpośrednio na materiale patologicznym i ma tę dużą wadę, że nie jest selektywny (wiemy, że jeden antybiotyk był mniej lub bardziej skuteczny niż inny w zmniejszaniu populacji drobnoustrojów, ale nie wiemy, jak aktywny jest przeciwko pojedynczy patogen). Natomiast w przypadku pośrednim czynnik patologiczny jest najpierw izolowany z próbki i tylko na nim wykonywane są różne badania.
Dla zahamowania zjawiska antybiotykooporności ważna jest również współpraca z pacjentem, który musi kontynuować terapię do czasu wyznaczonego przez lekarza, nie przerywając jej – jak to często bywa – przy pierwszych oznakach poprawy.